STR遗传标记分析
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短串联重复序列(short tandem repeat, STR),也称微卫星DNA(microsatellite DNA),是指以少数几个核苷酸(多数为2-6个)为单位多次串联重复的DNA序列。由于重复单位及重复次数不同,使其分布具有很大的差异性,构成了STR的遗传多态性,并按孟德尔规律呈共显性遗传。由于STR具有种属特异性、适合于复合扩增、使其在作物种质鉴定、亲缘关系分析、法医和亲子鉴定等领域都得到了广泛的应用。

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STR 作为遗传标记有以下优点:

  • 片段短,可以复合扩增,提高识别能力

  • 多态性程度高,等位基因多,鉴别能力强(在每个STR 位点上,多有几个到几十个等位片段)

  • 适合于陈旧的样品,检测能力强

  • 灵敏度高,有利于微量样品的检测

STR检测的应用:

  1. 品种鉴定

  2. 系谱分析

  3. 法医及亲子鉴定

  4. 群体间遗传距离分析

  5. 进化和遗传多样性研究

实验流程

STR位点序列的获取基因组DNA提取荧光标记引物设计、合成多重PCR扩增毛细管电泳检测→ Genemapper软件分析数据

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服务特色:

  • ABI 3730xl遗传分析系统,速度快,准确度高

  • 自有多种荧光探针合成,使用多荧光+内标的检测方式,通量大、速度快,并有效保证结果准确性

  • ABI GeneMapper 4.0Genemarker软件自动完成数据获取和处理分析,为后期结果分析提供可靠数据

  • 大批量样品,可免费代为PCR扩增

服务方案:

  • 跑板:客户提供特异性扩增的PCR产物及PCR鉴定电泳图,将PCR产物上机检测并软件自动读取实验结果,提供原始实验结果及简单结果分析

  • STR全套实验服务:根据客户实验需求,选取合适的STR位点、设计引物,并进行预实验以优化出的最佳实验方案。荧光修饰引物合成,根据优化方案进行正式STR扩增和检测实验,将数据进行分析整理,形成最终报告提交客户。

客户提供STR位点信息:

STR位点上下游各250bp序列,重复单位个数相关信息

STR分析所需样品的要求:

  • DNA样品:浓度≥20ng/ul,体积≥10ul(若位点数较多,则按1ul/位点准备),纯度OD 260/OD2801.71.9 之间。如果客户要求提供样品纯化服务,我们将收取纯化费;

  • 96孔板寄送DNA样品时,请用硅胶垫盖紧,并用锡纸包裹,以免样品渗漏或者荧光衰减;

  • 血液样品:体积大于500ul,用EDTA抗凝,送样过程中请注意保持低温,防止DNA降解;

  • 血斑样品:9-25mm2大小的血斑两个以上。对每个血样或血斑样本将收取DNA 提取费。若分型样品为细胞、组织样品,样本要求:细胞≥105,组织≥100mg,黄豆大小;

  • 寄送样品时,请在送样包裹中放置足量的冰袋,以减少在运输过程中因温度变化导致DNA降解的可能。

检测周期

常规检测任务1-3周内完成,具体时间根据STR位点及样本数而定。

我们提交结果

  • Genemapper分析图谱(PDF格式)及原始fsa格式峰型图

  • 各峰的相对分子量等具体信息(Excel格式)

  • 完整实验报告(包括引物序列、扩增反应体系,实验步骤等)

  • 数据分析软件及使用说明

联系方式

邮箱:snp@generay.com.cn

电话:021-67840429

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